Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q3U6N9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q3U6N9 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U6N9 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U6N9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U6N9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q3U6N9 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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