Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms