Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ulk3Q3U3Q1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ulk3Q3U3Q1 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ulk3Q3U3Q1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ulk3Q3U3Q1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ulk3Q3U3Q1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Ulk3Q3U3Q1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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