Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Rnf149Q3U2C5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Rnf149Q3U2C5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Rnf149Q3U2C5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Rnf149Q3U2C5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Rnf149Q3U2C5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Rnf149Q3U2C5 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Rnf149Q3U2C5 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Rnf149Q3U2C5 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Rnf149Q3U2C5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Rnf149Q3U2C5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf149Q3U2C5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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