Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc9Q3U0M1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms