Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hhla1Q3TYV2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms