Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Srsf6Q3TWW8 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms