Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ctdnep1Q3TP92 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctdnep1Q3TP92 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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