Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trappc10Q3TLI0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms