Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdlim7Q3TJD7 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms