Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Usp39Q3TIX9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Usp39Q3TIX9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Usp39Q3TIX9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Usp39Q3TIX9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp39Q3TIX9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Usp39Q3TIX9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Usp39Q3TIX9 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Usp39Q3TIX9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Usp39Q3TIX9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp39Q3TIX9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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