Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms