Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc69Q3TCJ8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms