Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hdgfl1Q2VPR5 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl1Q2VPR5 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hdgfl1Q2VPR5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hdgfl1Q2VPR5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hdgfl1Q2VPR5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdgfl1Q2VPR5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hdgfl1Q2VPR5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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