Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna5Q2MKA5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms