Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1aQ2LKU9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1aQ2LKU9 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms