Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Shroom4Q1W617 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms