Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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Samd11Q1RNF8 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Samd11Q1RNF8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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Samd11Q1RNF8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Samd11Q1RNF8 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Samd11Q1RNF8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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