Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cpne9Q1RLL3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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