Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpusd2Q149F1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rpusd2Q149F1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpusd2Q149F1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms