Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Traf3ip1Q149C2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Traf3ip1Q149C2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Traf3ip1Q149C2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf3ip1Q149C2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms