Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc162pQ0VG85 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms