Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Ttc39dQ0VF76 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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Ttc39dQ0VF76 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttc39dQ0VF76 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Ttc39dQ0VF76 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Ttc39dQ0VF76 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Ttc39dQ0VF76 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Ttc39dQ0VF76 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ttc39dQ0VF76 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttc39dQ0VF76 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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