Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spata18Q0P557 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms