Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TrioQ0KL02 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms