Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Pate4Q09098 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms