Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms