Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F13bQ07968 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
F13bQ07968 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms