Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cdx4Q07424 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Cdx4Q07424 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdx4Q07424 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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