Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cntn3Q07409 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms