Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah1bQ06985 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms