Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rcn1Q05186 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rcn1Q05186 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms