Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 1700016H13Rik-202ENSMUST00000119824 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 AC122539.3-201ENSMUST00000218355 1431 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sox12Q04890 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms