Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sox10Q04888 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms