Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cacna1cQ01815 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms