Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec23aQ01405 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms