Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Top2aQ01320 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Top2aQ01320 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms