Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gja5Q01231 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gja5Q01231 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gja5Q01231 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gja5Q01231 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gja5Q01231 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gja5Q01231 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gja5Q01231 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gja5Q01231 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja5Q01231 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja5Q01231 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja5Q01231 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja5Q01231 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja5Q01231 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gja5Q01231 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms