Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grin2bQ01097 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms