Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
PrcdQ00LT2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms