Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gfra1P97785 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms