Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pitx2P97474 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms