Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Bop1P97452 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Bop1P97452 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Bop1P97452 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Bop1P97452 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Bop1P97452 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Bop1P97452 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Bop1P97452 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Bop1P97452 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms