Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms