Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9xP70398 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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