Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gfi1P70338 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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