Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux2P70298 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux2P70298 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cux2P70298 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux2P70298 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux2P70298 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux2P70298 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cux2P70298 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cux2P70298 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cux2P70298 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms