Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tuba4aP68368 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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