Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Snrpd1P62315 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Snrpd1P62315 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Snrpd1P62315 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Snrpd1P62315 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Snrpd1P62315 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Snrpd1P62315 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Snrpd1P62315 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Snrpd1P62315 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Snrpd1P62315 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Snrpd1P62315 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Snrpd1P62315 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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