Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps5P59438 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps5P59438 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps5P59438 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps5P59438 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps5P59438 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps5P59438 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps5P59438 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps5P59438 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hps5P59438 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms